Al mudarse a Tokio para vivir con su tía, Misaki Suzuhara, de doce años, se deja fascinar por Angelic Layer, un deporte nacional en el que los jugadores, llamados Deus, manejan muñecas de combate llamadas Ángeles en pequeños cuadriláteros. Icchan, un mentor excéntrico, la anima a construir su propio Ángel, Hikaru, ligero y veloz pero capaz de golpes sorprendentes. Decidida a hacerse un nombre, Misaki se enfrenta a sus primeros combates contra rivales ya experimentados de la ciudad.