El Zero Requiem es el punto de partida de este manga: un plan que convierte a Lelouch vi Britannia en el enemigo único que todas las naciones pueden acordar destruir. Ya en el trono imperial, con el mundo entero en su contra, Lelouch ejecuta lo que acordó con Suzaku Kururugi y el relato lo sigue hasta el final. En vez de reiniciar la historia desde el Área 11, esta versión rehace el tramo final de Lelouch of the Rebellion R2.