Una lluvia de estrellas fugaces trae a Mepple y Mipple, refugiados del Jardín de la Luz, que cayó en manos de las fuerzas de la oscuridad. Así llegan a la vida de dos compañeras de escuela que no podrían ser más distintas: Nagisa Misumi, la deportista, y Honoka Yukishiro, la estudiosa. Gracias a ellos, las chicas obtienen el poder de convertirse en Cure Black y Cure White, que juntas forman Pretty Cure. Esta versión en manga se publicó como historietas cortas en paralelo al anime de televisión.