Ninjas portadores de raros kekkei genkai começam a sumir de quatro das grandes vilas e, como Konoha permanece intocada, as suspeitas caem sobre ela; o daimyo do País do Fogo ordena que Tsunade encontre os culpados ou veja a vila ser destruída. Sob uma maldição ligada a Hiruko, o homem por trás dos desaparecimentos, Kakashi Hatake deixa Konoha e é marcado como ninja renegado. Naruto Uzumaki e Sakura Haruno partem atrás do mestre antes que a guerra exploda nas fronteiras.