Amu Hinamori, a estudante da Academia Seiyo cujo desejo de encontrar seu eu idealizado fez nascer os Guardian Characters Ran, Miki, Su e Dia, volta em uma terceira temporada. Como Guardiã e Joker responsável por purificar os ovos do coração corrompidos, ela agora conhece Rikka, uma animada aluna transferida que também enxerga as pequenas companheiras. A temporada leva o elenco conhecido a novas confusões do dia a dia em Seiyo.