Um ano depois de a deusa Belldandy sair do espelho de Keiichi Morisato e decidir ficar, o contrato que une os dois se perde quando dados são apagados no Céu. Para restaurá-lo, Keiichi precisa lembrar as palavras exatas de seu desejo original. Esta segunda temporada acompanha a vida tranquila do casal em Nekomi Tech enquanto novas complicações se acumulam: uma caloura chamada Shiho, a deusa Peorth decidida a realizar o desejo mais profundo de Keiichi e a demônia Mara aprontando de novo.