Un año después de que la diosa Belldandy saliera del espejo de Keiichi Morisato y decidiera quedarse, el contrato que los une se pierde al borrarse unos datos en el Cielo. Para recuperarlo, Keiichi tiene que recordar las palabras exactas de su deseo original. Esta segunda temporada sigue la vida tranquila de la pareja en Nekomi Tech mientras se acumulan enredos nuevos: una novata llamada Shiho, la diosa Peorth empeñada en concederle a Keiichi su deseo más profundo y la demonio Mara armando líos.