Aluno de uma escola de Tóquio, Setsuna Mudo vive atormentado por sentimentos proibidos pela irmã mais nova, Sara. Ele acaba descobrindo que é a reencarnação de Alexiel, um anjo que se rebelou contra o Céu e foi condenado a renascer sem fim como humano. Conforme anjos e demônios se interessam por esse renascimento, Setsuna é puxado para uma guerra entre o Céu e o Inferno que gira em torno da alma dentro dele.