O piloto Hikaru Ichijou resgata a idol Minmay Lynn de uma seção em colapso do SDF-1 Macross, e os dias presos juntos os aproximam. Depois do resgate, um passeio pelos anéis de Saturno termina com Hikaru, Minmay, a tenente Misa Hayase, o primo de Minmay, Kaifun, e o piloto Roy Focker capturados pelos Zentradi. Isolado com Misa numa Terra devastada por ataques Zentradi anteriores, Hikaru descobre ruínas ligadas à antiga Protocultura, e uma canção encontrada entre elas pode ser a única capaz de encerrar a guerra. Este filme reconta a série de TV original de Super Dimension Fortress Macross.