Três anos depois que a nave-mãe alienígena pousou em silêncio sobre Tóquio, as colegiais Kadode Koyama e Ouran Nakagawa só querem terminar o último ano escolar como todo mundo. O pai de Kadode, Hiroshi Nakagawa, e o colega Keita Ooba orbitam as protagonistas enquanto boatos se espalham sobre o que a nave está esperando. A rotina de lição de casa, trabalhos de meio período e amizades continua mesmo com as simulações de evacuação e os noticiários lembrando que a ameaça nunca foi embora. Esta versão em formato ONA remonta a mesma história dos dois filmes de cinema em uma série completa, dividida em episódios.