Tres años después de que la nave nodriza alienígena se posara en silencio sobre Tokio, las estudiantes Kadode Koyama y Ouran Nakagawa solo intentan terminar su último año escolar como todos los demás. El padre de Kadode, Hiroshi Nakagawa, y su compañero Keita Ooba giran alrededor de las protagonistas mientras corren rumores sobre qué espera la nave. La rutina de tareas, trabajos de medio tiempo y amistades sigue adelante aunque los simulacros de evacuación y los noticieros recuerden que la amenaza nunca se fue. Esta versión en formato ONA remonta la misma historia de las dos películas de cine en una serie completa por episodios.