Una chica llamada Musubi cae del cielo justo encima de Minato Sahashi, un joven inteligente pero inseguro que ya reprobó dos veces el examen de ingreso a la universidad. Ella es una Sekirei, una de las 108 criaturas con poderes, y elige a Minato como su Ashikabi: sella el vínculo con un beso que libera toda su fuerza. Ese vínculo los inscribe en el Plan Sekirei, un torneo de supervivencia organizado por la corporación MBI, y pronto más Sekirei se unen a Minato, llenando su departamento y las peleas en las que nunca pidió meterse.