Diez años antes de los hechos de Fate/stay night, siete magos invocan a héroes legendarios como Servants y libran la Cuarta Guerra del Santo Grial en la ciudad de Fuyuki, una lucha sin tregua por un Grial capaz de conceder deseos. Kiritsugu Emiya entra en nombre de la familia Einzbern: un mercenario despiadado que alguna vez soñó con salvar a todos y ahora vence por cualquier medio, con la orgullosa rey-caballero Saber como su Servant. A su alrededor, otros Masters y sus Servants persiguen ideales opuestos de heroísmo y victoria. Esta es la precuela Fate/Zero de Gen Urobuchi.