Desde un departamento de Akihabara, Rintarou Okabe dirige el Laboratorio de Gadgets del Futuro junto a Mayuri Shiina e Itaru "Daru" Hashida, y se presenta a sí mismo como científico loco. Un microondas modificado termina enviando mensajes de texto al pasado, y SERN se fija en el hallazgo. Estas novelas ligeras vuelven a contar esa historia en varios tomos, y uno de ellos la sigue desde el lado de Kurisu Makise, que percibe cómo cambia la línea de mundo.