Una espía de la Organización Negra con el nombre en clave Curaçao roba una lista clasificada de vigilancia de la policía nacional japonesa y huye por el puente Rainbow en una persecución que involucra al agente del FBI Shuichi Akai y al policía encubierto Toru Amuro. Cuando su auto cae al agua cerca del acuario de Tohto, la Liga Juvenil de Detectives la encuentra con vida pero sin memoria de quién es ni de lo que robó. Conan Edogawa y Ai Haibara la acogen y empiezan a reconstruir su identidad, sin saber lo peligrosa que es en realidad la mujer que están protegiendo.