Maya Kumashiro detesta todo lo relacionado con lo oculto, pero la muerte de su padre la obliga a volver a la Academia Waldstein, famosa por sus incidentes sobrenaturales, para asumir como directora y cerrarla de una vez por todas. Sus planes se desmoronan cuando un desconocido que dice llamarse Minoru Abe cae del cielo asegurando ser un agente del tiempo venido de 2012, enviado a 1999 para evitar que se cumplan las profecías de Nostradamus. A regañadientes, Maya se alía con él para investigar los extraños fenómenos de la academia y descubrir para qué lo enviaron en realidad.