Los cerezos de Hatsunejima siguen floreciendo fuera de temporada, como desde el comienzo de Da Capo, y los deseos que se les atribuyen todavía se cuelan en los días de clase. En ese marco, Nemu Asakura regresa a casa y la rutina de Junichi Asakura se reacomoda alrededor de la vuelta de su hermana. El manga, de tres tomos, adapta el juego Da Capo Second Graduation y se queda con la generación de Junichi, no con el elenco posterior de Da Capo II.