Rem caiu em um sono do qual ninguém consegue despertá-la, e com ele se foram o nome dela e o seu lugar na memória de todos. Subaru Natsuki volta com Emilia à mansão do margrave Roswaal atrás de qualquer pista que possa trazê-la de volta. A busca os leva ao Santuário, um refúgio escondido criado pela bruxa Echidna e ligado à infância soterrada de Emilia, e chegar até lá significa enfrentar o que guarda seus segredos. Beatrice e o espírito Pack completam o círculo próximo de Subaru enquanto o mistério sempre volta a apontar para pessoas que ele ainda não entende de verdade.