Takashi Natsume puede ver a los youkai que la gente común no percibe, y carga el Libro de los Amigos, un registro que su abuela Reiko llenó con los nombres de los espíritus que sometió. Esta sexta temporada continúa su costumbre de devolver esos nombres para liberar a los youkai que vienen a reclamarlos, siempre con su guardián Nyanko-sensei a su lado. Los nuevos encuentros lo acercan cada vez más al mundo de los espíritus mientras sigue tejiendo los lazos humanos cotidianos que no tuvo de niño.