Haruhi Suzumiya se presenta ante su clase declarando que solo le interesan los alienígenas, los viajeros del tiempo y los espers. A su lado se sienta Kyon, un estudiante de primer año de preparatoria que hace mucho dejó de creer en lo sobrenatural. Un comentario suyo inspira a Haruhi a fundar la Brigada SOS para buscarlos, y arrastra con ella a la callada lectora Yuki Nagato, a la tímida Mikuru Asahina y al siempre sonriente Itsuki Koizumi. Pronto Kyon descubre que los tres son justo lo que Haruhi busca, enviados a vigilarla. Este manga adapta las novelas ligeras.