Tras el suicidio de una compañera de clase, Lain Iwakura, de catorce años, recibe un correo de la chica muerta. En él afirma que solo abandonó su cuerpo para vivir dentro del Wired, una red de comunicación global parecida a un internet mucho más inmersivo. Lain, que apenas sabía usar una computadora, se obsesiona con el Wired y amplía su equipo hasta llenar la habitación entera. Cuanto más investiga, más rastros encuentra de sí misma ya activa en la red, y la frontera entre el Wired y el mundo físico empieza a disolverse.