Tras la moratoria global simultánea, el mundo funciona gracias a la Guerra Sostenible, y Motoko Kusanagi opera en California con GHOST, la cuadrilla mercenaria que armó con sus antiguos compañeros de la Sección 9. Daisuke Aramaki los llama de vuelta a Japón, donde los esperan los poshumanos: individuos cuyo cerebro mutó hasta superar cualquier contramedida. La película condensa la primera temporada de Netflix, recolorea el material y suma escenas nuevas, así que vuelve a contar esa temporada en lugar de continuarla.