Os sonhos de Roxas giram em torno de Sora, um garoto que ele nunca conheceu, justo quando as férias de verão em Twilight Town chegam ao fim. Enquanto ele tenta curtir os últimos dias com Hayner, Pence e Olette, o grupo é acusado de roubar fotos pela cidade e criaturas brancas esquisitas partem para o ataque. Então surge Naminé, uma garota com um segredo para revelar a ele. O mangá de Shiro Amano adapta o jogo Kingdom Hearts II a começar pelo prólogo em Twilight Town.