El Rompecabezas del Milenio, una reliquia del antiguo Egipto guardada en la tienda de juegos de su abuelo, pasa años sin armarse hasta que el tímido Yugi Mutou encaja la última pieza. Al resolverlo despierta una segunda personalidad, Dark Yugi, el espíritu de un faraón sin nombre que toma el control para retar a abusivos y criminales a Juegos de las Sombras y aplicarles crueles Juegos de Castigo. Junto a sus amigos Anzu, Jonouchi y Honda, Yugi llama la atención de rivales que portan los demás Objetos del Milenio, como el coleccionista Seto Kaiba.