Los tres hermanos Kumo cuidan un santuario a la orilla del lago Biwa: el mayor, Tenka, el del medio, Soramaru, y el pequeño, Chutaro. Su trabajo es trasladar presos hasta Gokumonjo, una prisión levantada sobre una isla del lago, porque el nuevo gobierno Meiji ya prohíbe portar espadas en público y los delitos no dejan de crecer. Tras esa rutina acecha una amenaza antigua: Orochi, la serpiente que resurge cada trescientos años, y el recipiente humano destinado a contenerla.