En el Nine Schools Competition, el torneo anual de magia entre escuelas, Tatsuya Shiba se desempeña como ingeniero del equipo de First High, mientras su hermana Miyuki compite como una de sus figuras destacadas. También integran la delegación Mayumi Saegusa, presidenta del consejo estudiantil y alumna de tercer año, y las compañeras de clase de Tatsuya, Erika Chiba y Shizuku Kitayama. Su inusual puesto como estudiante de Curso 2 despierta sospechas tanto de escuelas rivales como de la suya propia. Este manga adapta el segundo arco de las novelas ligeras de Mahouka.